Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD13P35453 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms