Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms