Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms