Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL9P32969 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL9P32969 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL9P32969 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL9P32969 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL9P32969 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL9P32969 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL9P32969 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL9P32969 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL9P32969 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL9P32969 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL9P32969 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms