Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD11P31277 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms