Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRPAP1P30533 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRPAP1P30533 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms