Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECHS1P30084 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ECHS1P30084 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECHS1P30084 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECHS1P30084 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ECHS1P30084 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECHS1P30084 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ECHS1P30084 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ECHS1P30084 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ECHS1P30084 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECHS1P30084 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECHS1P30084 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECHS1P30084 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECHS1P30084 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECHS1P30084 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECHS1P30084 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECHS1P30084 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms