Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA1P29973 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA1P29973 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA1P29973 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA1P29973 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA1P29973 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGA1P29973 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms