Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRMP28827 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms