Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms