Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLNP26678 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLNP26678 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLNP26678 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PLNP26678 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLNP26678 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms