Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA1P25786 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms