Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRM1P23921 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRM1P23921 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRM1P23921 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM1P23921 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM1P23921 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM1P23921 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM1P23921 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms