Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPREP23469 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPREP23469 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPREP23469 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPREP23469 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPREP23469 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPREP23469 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms