Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRBP23467 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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