Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms