Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKACBP22694 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms