Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNA5P22460 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNA5P22460 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms