Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGFR4P22455 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR4P22455 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms