Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms