Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD1P21695 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD1P21695 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD1P21695 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD1P21695 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD1P21695 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD1P21695 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD1P21695 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD1P21695 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD1P21695 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD1P21695 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD1P21695 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD1P21695 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD1P21695 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD1P21695 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD1P21695 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD1P21695 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD1P21695 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms