Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASTP20810 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASTP20810 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CASTP20810 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASTP20810 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASTP20810 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASTP20810 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASTP20810 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASTP20810 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms