Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB1P20618 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB1P20618 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms