Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRHP20396 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TRHP20396 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRHP20396 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRHP20396 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRHP20396 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRHP20396 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TRHP20396 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRHP20396 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRHP20396 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRHP20396 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRHP20396 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRHP20396 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRHP20396 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRHP20396 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TRHP20396 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRHP20396 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms