Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSP20132 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSP20132 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDSP20132 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDSP20132 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDSP20132 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDSP20132 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDSP20132 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSP20132 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms