Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMY2BP19961 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMY2BP19961 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms