Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATF1P18846 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATF1P18846 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATF1P18846 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATF1P18846 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATF1P18846 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATF1P18846 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms