Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB4P17483 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms