Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA1P17302 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA1P17302 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA1P17302 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA1P17302 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJA1P17302 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJA1P17302 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA1P17302 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA1P17302 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms