Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOT1P17174 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOT1P17174 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOT1P17174 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOT1P17174 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOT1P17174 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOT1P17174 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOT1P17174 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOT1P17174 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOT1P17174 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOT1P17174 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOT1P17174 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms