Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT13P13646 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT13P13646 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT13P13646 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT13P13646 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT13P13646 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT13P13646 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms