Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RLBP1P12271 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms