Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP1P11387 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP1P11387 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP1P11387 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP1P11387 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP1P11387 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP1P11387 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP1P11387 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP1P11387 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP1P11387 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP1P11387 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms