Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB1P11230 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB1P11230 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms