Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RARBP10826 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RARBP10826 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARBP10826 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARBP10826 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARBP10826 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARBP10826 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARBP10826 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARBP10826 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARBP10826 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARBP10826 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARBP10826 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARBP10826 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARBP10826 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms