Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR29P0C7W0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms