Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47B1P0C2W7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47B1P0C2W7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47B1P0C2W7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CT47B1P0C2W7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CT47B1P0C2W7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47B1P0C2W7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms