Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI1P08151 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI1P08151 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI1P08151 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI1P08151 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GLI1P08151 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GLI1P08151 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI1P08151 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI1P08151 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms