Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPM2P07951 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPM2P07951 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPM2P07951 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPM2P07951 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPM2P07951 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM2P07951 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM2P07951 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM2P07951 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM2P07951 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM2P07951 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPM2P07951 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM2P07951 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms