Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3DP05423 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3DP05423 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms