Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYCNP04198 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYCNP04198 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYCNP04198 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYCNP04198 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYCNP04198 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYCNP04198 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYCNP04198 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYCNP04198 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYCNP04198 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYCNP04198 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYCNP04198 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYCNP04198 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYCNP04198 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYCNP04198 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYCNP04198 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYCNP04198 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYCNP04198 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms