Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD4P01730 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD4P01730 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD4P01730 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD4P01730 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD4P01730 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD4P01730 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD4P01730 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD4P01730 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD4P01730 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD4P01730 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD4P01730 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms