Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD3O95983 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD3O95983 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD3O95983 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD3O95983 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD3O95983 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD3O95983 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD3O95983 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD3O95983 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MBD3O95983 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD3O95983 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD3O95983 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD3O95983 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD3O95983 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD3O95983 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MBD3O95983 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms