Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC2O95714 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC2O95714 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERC2O95714 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC2O95714 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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