Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STAMBPO95630 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
STAMBPO95630 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms