Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF6BO95407 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms