Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM2O94769 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ECM2O94769 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECM2O94769 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECM2O94769 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM2O94769 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM2O94769 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM2O94769 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM2O94769 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM2O94769 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms