Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCTN3O75935 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms