Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPM3O75607 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPM3O75607 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPM3O75607 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPM3O75607 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPM3O75607 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms