Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms